dcm2niix
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相关链接
主页
https://www.nitrc.org/plugins/mwiki/index.php/dcm2nii:MainPage
仓库
https://github.com/rordenlab/dcm2niix/
使用方法
如果要需要BIDS结构的数据,建议直接使用dcm2bids。
在 dcm2bids 中使用的命令为:
dcm2niix -b y -ba y -z y -f %3s_%f_%p_%t -o /path/to/output_dir /path/to/dicom_dir-b y 指生成 BIDS 格式的 .json 文件(sidecar 文件)。
-ba y 指在生成的 .json 文件中开启匿名化。
-z y 指开启压缩,将输出保存为 .nii.gz 格式。
-f %3s_%f_%p_%t 指定了输出文件名的格式,即”3位扫描序列号_原文件夹名_ProtocolName_扫描时间“。
芷沐沐